Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cspg5Q71M36 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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