Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms