Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms