Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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