Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtss1lQ6P9S0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtss1lQ6P9S0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms