Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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