Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms