Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tpm4Q6IRU2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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