Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ParpbpQ6IRT3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms