Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt77Q6IFZ6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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Krt77Q6IFZ6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Krt77Q6IFZ6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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Krt77Q6IFZ6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Krt77Q6IFZ6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt77Q6IFZ6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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