Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms