Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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Pdzrn3Q69ZS0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Pdzrn3Q69ZS0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Pdzrn3Q69ZS0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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Pdzrn3Q69ZS0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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