Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

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Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sbno1Q689Z5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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