Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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