Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms