Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r1bQ60829 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp1r1bQ60829 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms