Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SkiQ60698 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SkiQ60698 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SkiQ60698 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms