Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf12Q5SPL2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms