Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Trim58Q5NCC9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Trim58Q5NCC9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Trim58Q5NCC9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Trim58Q5NCC9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Trim58Q5NCC9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Trim58Q5NCC9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Trim58Q5NCC9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Trim58Q5NCC9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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