Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms