Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpkowQ56A08 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms