Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms