Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms