Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms