Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ankrd53Q3V0J4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ankrd53Q3V0J4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ankrd53Q3V0J4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ankrd53Q3V0J4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms