Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttc9Q3V038 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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