Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms