Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Q3UJP5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UJP5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UJP5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UJP5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UJP5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms