Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms