Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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