Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms