Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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