Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy4Q3TYX8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy4Q3TYX8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms