Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hhla1Q3TYV2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms