Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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