Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fndc4Q3TR08 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fndc4Q3TR08 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms