Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrx1Q3TL44 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrx1Q3TL44 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms