Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms