Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Treml4Q3LRV9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Treml4Q3LRV9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Treml4Q3LRV9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms