Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms