Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms