Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Fam178bQ24JP3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms