Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Shroom4Q1W617 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Shroom4Q1W617 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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