Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Cpne9Q1RLL3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Cpne9Q1RLL3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Cpne9Q1RLL3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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