Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms