Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms