Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms