Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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