Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah1bQ06985 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms