Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3bp2Q06649 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3bp2Q06649 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3bp2Q06649 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3bp2Q06649 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3bp2Q06649 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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